Po havárii zůstal program raketoplánů uzemněn 32 měsíců. NASA přepracovala konstrukci spojů pomocných motorů (nový těsnicí systém, ohřívače spojů) a zavedla přísnější pravidla pro rozhodování o startu.
K dalšímu letu se program vrátil 29. září 1988 misí STS-26 raketoplánu Discovery. Náhradou za ztracený Challenger byl postaven nový orbiter Endeavour, který poprvé odstartoval v roce 1992.
Barbara Morganová, záložnice Christy McAuliffeové v programu „Učitel ve vesmíru", se stala profesionální astronautkou a do vesmíru nakonec letěla v roce 2007 na misi STS-118 — jako první profesí učitelka ve vesmíru, jednadvacet let po havárii. Posádka STS-51-L je připomínána Vesmírným zrcadlem (Space Mirror Memorial) v Kennedyho vesmírném středisku.
NASA — Challenger (STS-51-L) Accident · NASA — Posádka STS-51-L · NASA — STS-51-L (přehled mise) — úplný seznam na hesle STS-51-L